第一部1-7卷[完]
故事主要讲述了在纽约市一条大街的地下管道里住着四只功夫高强的忍者神龟和他们的老师斯普林特——只来自日本的超级大老鼠，为了保卫城市家园，他们同狡猾的巴克斯特·斯多克曼博士、紫龙帮的坏蛋以及一伙神秘且训练有素的忍者展开殊死搏斗。这四只神勇无比、所向无敌、神气十足的小乌龟，手执忍者刀、武士棒、双截棍和钢叉，披挂上阵英勇迎敌，团结如兄弟，不畏邪恶与恐吓，始终与妖魔鬼怪斗争着。
第二部1卷[完]
该片部分改编自James Tynion IV与Freddie Williams II于2015年所创作的DC漫画，华纳动画拍出了这一宇宙交叉的电影，动画风格与“蝙蝠侠”和“忍者神龟”这两个世界都非常契合。两个世界的英雄们也在共同抗击入侵哥谭市的敌人们，其中包括“忍者神龟”世界中的大反派“施莱德”（Shredder）和“大脚帮”（Foot Clan）。施莱德和包括拉尔斯·艾尔·古尔（Ra’s Al Ghul）在内“蝙蝠侠”世界中的反派结了盟，势要完成他们在哥谭的邪恶勾当 。
第三部1-2卷[完]
忍者神龟被一把神奇的魔杖传送到了17世纪的日本，他们将在那里对抗邪恶的Norinaga勳爵,并夺回魔杖拯救纽约市
忍者神龟2011 1-6卷[完]
，2011年，IDW接手版权重启剧情，开始漫画《TMNT》IDW系列
忍者神龟历险记1-2卷[完] ，1988年，87版漫画《TMNT Adventure》由阿奇漫画公司（Archie Comics）出版，
请先 ！